ILVO-onderzoeker Bavo Verhaegen zijn doctoraatonderzoek aan UGent met succes verdedigde heeft gewerkt op de zogenaamde niet-O157 STEC, een groep STEC-bacteriën die vaak met weinig succes werden gedetecteerd in voeding doordat geschikte analysemethoden niet voorhanden waren.

Kenmerkend

Escherichia coli zijn darmbacteriën die over het algemeen deel uitmaken van de gezonde darmflora bij mens en dier. Maar, enkele types E. coli, zoals de Shiga-toxine producerende E. coli oftewel STEC, veroorzaken wél milde tot zeer ernstige ziektes bij de mens. Daarom wordt STEC tegenwoordig wereldwijd genoemd bij de belangrijkste voedseloverdraagbare ziektekiemen.

Serogroepen

STEC-bacteriën kunnen worden onderverdeeld in verschillende typen, de zogenaamde serogroepen.

Voedselproducten die in aanraking geweest zijn met rundermest (zo bijv. rundsvlees, filet américain, rauwe melkproducten maar ook met rundermest bemeste groenten,…) krijgen extra aandacht in toekomstige preventieve voedselveiligheidsmonitoring. Doch hiervoor zijn performante analysemethoden noodzakelijk.

STEC-serogroep O157

Tot voor enkele jaren lag de nadruk vooral op de zogenaamde STEC-serogroep O157 (die het meeste voorkomt) en bestonden minder performante methoden voor de niet-O157 STEC-serogroepen, die in opmars zijn en die agressief uit de hoek kunnen komen.

Kweekmethode

Bavo Verhaegen is er allereerst in geslaagd om de meest geschikte middelen te vinden om de niet-O157 serogroepen in voedingsstalen op te sporen met behulp van een kweekmethode.

Uit analyse van een hele reeks kunstmatige gecontamineerde voedselmatrices bleek het gecombineerde gebruik van zowel een hoog-selectief als een laag-selectief isolatiemedium het beste resultaat op te leveren. Een extra zuurbehandeling tijdens de isolatieprocedure bleek bovendien bijzonder effectief voor de isolatie van STEC uit sojascheutstalen, een risicovol product.

Karakterisering

Vervolgens heeft Verhaegen gewerkt aan een karakterisering van de STEC-stammen geïsoleerd uit een levensmiddel. Pas met een probate karakteriseringsmethode kan men het risico van een bepaalde stam voor de volksgezondheid inschatten.

ddPCR

Daarnaast heeft de onderzoeker een vernieuwende methode, de droplet digital PCR (ddPCR), op punt gezet om STEC te kwantificeren. Deze geoptimaliseerde ddPCR zou in de toekomst perspectieven kunnen bieden om runderen te gaan onderzoeken op een hoge uitscheiding van STEC en voor een efficiëntere screening van STEC in levensmiddelen.